Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf1bP97358 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms