Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf3P70671 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms