Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fgf11P70378 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fgf11P70378 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms