Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsnl1P62761 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms