Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Snrpd3P62320 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms