Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vbp1P61759 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vbp1P61759 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Vbp1P61759 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vbp1P61759 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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