Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snap25P60879 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms