Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcbp1P60335 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcbp1P60335 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms