Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TdgP56581 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TdgP56581 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TdgP56581 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TdgP56581 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TdgP56581 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdgP56581 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdgP56581 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms