Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms