Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Efnb1P52795 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms