Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp1P52624 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Upp1P52624 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms