Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CcnfP51944 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnfP51944 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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