Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr5P51682 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms