Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms