Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpbP50405 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpbP50405 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SftpbP50405 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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