Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VdrP48281 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VdrP48281 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VdrP48281 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VdrP48281 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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