Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CskP41241 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CskP41241 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CskP41241 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CskP41241 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CskP41241 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CskP41241 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CskP41241 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CskP41241 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CskP41241 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CskP41241 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms