Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprkP35822 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms