Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms