Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nedd1P33215 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms