Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc5P32043 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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