Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxc11P31313 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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