Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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