Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CftrP26361 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CftrP26361 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CftrP26361 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CftrP26361 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CftrP26361 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CftrP26361 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CftrP26361 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CftrP26361 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms