Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfaP23607 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfaP23607 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfaP23607 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZfaP23607 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZfaP23607 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms