Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3aP23116 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eif3aP23116 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms