Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sptan1P16546 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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