Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Irf1P15314 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Irf1P15314 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Irf1P15314 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Irf1P15314 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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