Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01653 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01653 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01653 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01653 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01653 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01653 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01653 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms