Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BlmO88700 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BlmO88700 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BlmO88700 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BlmO88700 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BlmO88700 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BlmO88700 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms