Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb3O54890 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms