Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2bO35690 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Phox2bO35690 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Phox2bO35690 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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