Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccrl2O35457 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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