Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ColqO35348 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ColqO35348 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ColqO35348 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ColqO35348 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ColqO35348 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ColqO35348 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms