Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1aO35134 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms