Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eftud2O08810 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eftud2O08810 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eftud2O08810 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms