Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20878L7N244 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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