Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21310J3QQ23 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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