Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm21900J3QP38 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21900J3QP38 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21900J3QP38 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21900J3QP38 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21900J3QP38 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21900J3QP38 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm21900J3QP38 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm21900J3QP38 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm21900J3QP38 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm21900J3QP38 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm21900J3QP38 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21900J3QP38 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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