Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms