Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gm21972J3QN38 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21972J3QN38 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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