Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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