Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21060J3KMU4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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