Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms