Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XntrpcF8VQM8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms