Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3371F7CQW8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3371F7CQW8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms