Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms