Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pagr1bF6V0H0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms