Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Pdzd2E9Q1M1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdzd2E9Q1M1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms